Paul Spellman

Professor

  • 71981 Citations
  • 69 h-Index
1992 …2021

Research output per year

If you made any changes in Pure these will be visible here soon.

Research Output

Filter
Review article
2017

Circulating-tumor DNA as an early detection and diagnostic tool

Butler, T. M., Spellman, P. & Gray, J., Feb 1 2017, In : Current Opinion in Genetics and Development. 42, p. 14-21 8 p.

Research output: Contribution to journalReview article

28 Scopus citations
2013

The cancer genome atlas pan-cancer analysis project

Weinstein, J. N., Collisson, E. A., Mills, G. B., Shaw, K. R. M., Ozenberger, B. A., Ellrott, K., Sander, C., Stuart, J. M., Chang, K., Creighton, C. J., Davis, C., Donehower, L., Drummond, J., Wheeler, D., Ally, A., Balasundaram, M., Birol, I., Butterfield, Y. S. N., Chu, A., Chuah, E. & 316 others, Chun, H. J. E., Dhalla, N., Guin, R., Hirst, M., Hirst, C., Holt, R. A., Jones, S. J. M., Lee, D., Li, H. I., Marra, M. A., Mayo, M., Moore, R. A., Mungall, A. J., Robertson, A. G., Schein, J. E., Sipahimalani, P., Tam, A., Thiessen, N., Varhol, R. J., Beroukhim, R., Bhatt, A. S., Brooks, A. N., Cherniack, A. D., Freeman, S. S., Gabriel, S. B., Helman, E., Jung, J., Meyerson, M., Ojesina, A. I., Pedamallu, C. S., Saksena, G., Schumacher, S. E., Tabak, B., Zack, T., Lander, E. S., Bristow, C. A., Hadjipanayis, A., Haseley, P., Kucherlapati, R., Lee, S., Lee, E., Luquette, L. J., Mahadeshwar, H. S., Pantazi, A., Parfenov, M., Park, P. J., Protopopov, A., Ren, X., Santoso, N., Seidman, J., Seth, S., Song, X., Tang, J., Xi, R., Xu, A. W., Yang, L., Zeng, D., Auman, J. T., Balu, S., Buda, E., Fan, C., Hoadley, K. A., Jones, C. D., Meng, S., Mieczkowski, P. A., Parker, J. S., Perou, C. M., Roach, J., Shi, Y., Silva, G. O., Tan, D., Veluvolu, U., Waring, S., Wilkerson, M. D., Wu, J., Zhao, W., Bodenheimer, T., Hayes, D. N., Hoyle, A. P., Jeffreys, S. R., Mose, L. E., Simons, J. V., Soloway, M. G., Baylin, S. B., Berman, B. P., Bootwalla, M. S., Danilova, L., Herman, J. G., Hinoue, T., Laird, P. W., Rhie, S. K., Shen, H., Triche, T., Weisenberger, D. J., Carter, S. L., Cibulskis, K., Chin, L., Zhang, J., Sougnez, C., Wang, M., Getz, G., Dinh, H., Doddapaneni, H. V., Gibbs, R., Gunaratne, P., Han, Y., Kalra, D., Kovar, C., Lewis, L., Morgan, M., Morton, D., Muzny, D., Reid, J., Xi, L., Cho, J., Dicara, D., Frazer, S., Gehlenborg, N., Heiman, D. I., Kim, J., Lawrence, M. S., Lin, P., Liu, Y., Noble, M. S., Stojanov, P., Voet, D., Zhang, H., Zou, L., Stewart, C., Bernard, B., Bressler, R., Eakin, A., Iype, L., Knijnenburg, T., Kramer, R., Kreisberg, R., Leinonen, K., Lin, J., Liu, Y., Miller, M., Reynolds, S. M., Rovira, H., Shmulevich, I., Thorsson, V., Yang, D., Zhang, W., Amin, S., Wu, C. J., Wu, C. C., Akbani, R., Aldape, K., Baggerly, K. A., Broom, B., Casasent, T. D., Cleland, J., Dodda, D., Edgerton, M., Han, L., Herbrich, S. M., Ju, Z., Kim, H., Lerner, S., Li, J., Liang, H., Liu, W., Lorenzi, P. L., Lu, Y., Melott, J., Nguyen, L., Su, X., Verhaak, R., Wang, W., Wong, A., Yang, Y., Yao, J., Yao, R., Yoshihara, K., Yuan, Y., Yung, A. K., Zhang, N., Zheng, S., Ryan, M., Kane, D. W., Aksoy, B. A., Ciriello, G., Dresdner, G., Gao, J., Gross, B., Jacobsen, A., Kahles, A., Ladanyi, M., Lee, W., Lehmann, K. V., Miller, M. L., Ramirez, R., Rätsch, G., Reva, B., Schultz, N., Senbabaoglu, Y., Shen, R., Sinha, R., Sumer, S. O., Sun, Y., Taylor, B. S., Weinhold, N., Fei, S., Spellman, P., Benz, C., Carlin, D., Cline, M., Craft, B., Goldman, M., Haussler, D., Ma, S., Ng, S., Paull, E., Radenbaugh, A., Salama, S., Sokolov, A., Swatloski, T., Uzunangelov, V., Waltman, P., Yau, C., Zhu, J., Hamilton, S. R., Abbott, S., Abbott, R., Dees, N. D., Delehaunty, K., Ding, L., Dooling, D. J., Eldred, J. M., Fronick, C. C., Fulton, R., Fulton, L. L., Kalicki-Veizer, J., Kanchi, K. L., Kandoth, C., Koboldt, D. C., Larson, D. E., Ley, T. J., Lin, L., Lu, C., Magrini, V. J., Mardis, E. R., McLellan, M. D., McMichael, J. F., Miller, C. A., O'Laughlin, M., Pohl, C., Schmidt, H., Smith, S. M., Walker, J., Wallis, J. W., Wendl, M. C., Wilson, R. K., Wylie, T., Zhang, Q., Burton, R., Jensen, M. A., Kahn, A., Pihl, T., Pot, D., Wan, Y., Levine, D. A., Black, A. D., Bowen, J., Frick, J., Gastier-Foster, J. M., Harper, H. A., Helsel, C., Leraas, K. M., Lichtenberg, T. M., McAllister, C., Ramirez, N. C., Sharpe, S., Wise, L., Zmuda, E., Chanock, S. J., Davidsen, T., Demchok, J. A., Eley, G., Felau, I., Sheth, M., Sofia, H., Staudt, L., Tarnuzzer, R., Wang, Z., Yang, L., Zhang, J., Omberg, L., Margolin, A., Raphael, B. J., Vandin, F., Wu, H. T., Leiserson, M. D. M., Benz, S. C., Vaske, C. J., Noushmehr, H., Wolf, D., Veer, L. V. T., Anastassiou, D., Yang, T. H. O., Lopez-Bigas, N., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Xia, Z., Li, W., Cho, D. Y., Przytycka, T., Hamilton, M., McGuire, S., Nelander, S., Johansson, P., Jörnsten, R. & Kling, T., Oct 1 2013, In : Nature genetics. 45, 10, p. 1113-1120 8 p.

Research output: Contribution to journalReview article

2137 Scopus citations
2010

International network of cancer genome projects

Hudson, T. J., Anderson, W., Aretz, A., Barker, A. D., Bell, C., Bernabé, R. R., Bhan, M. K., Calvo, F., Eerola, I., Gerhard, D. S., Guttmacher, A., Guyer, M., Hemsley, F. M., Jennings, J. L., Kerr, D., Klatt, P., Kolar, P., Kusuda, J., Lane, D. P., Laplace, F. & 241 others, Lu, Y., Nettekoven, G., Ozenberger, B., Peterson, J., Rao, T. S., Remacle, J., Schafer, A. J., Shibata, T., Stratton, M. R., Vockley, J. G., Watanabe, K., Yang, H., Yuen, M. M. F., Knoppers, B. M., Bobrow, M., Cambon-Thomsen, A., Dressler, L. G., Dyke, S. O. M., Joly, Y., Kato, K., Kennedy, K. L., Nicolás, P., Parker, M. J., Rial-Sebbag, E., Romeo-Casabona, C. M., Shaw, K. M., Wallace, S., Wiesner, G. L., Zeps, N., Lichter, P., Biankin, A. V., Chabannon, C., Chin, L., Clément, B., Alava, E. D., Degos, F., Ferguson, M. L., Geary, P., Hayes, D. N., Johns, A. L., Kasprzyk, A., Nakagawa, H., Penny, R., Piris, M. A., Sarin, R., Scarpa, A., De Vijver, M. V., Futreal, P. A., Aburatani, H., Bayés, M., Bowtell, D. D. L., Campbel, P. J., Estivill, X., Grimmond, S. M., Gut, I., Hirst, M., López-Otý́n, C., Majumder, P., Marra, M., McPherson, J. D., Ning, Z., Puente, X. S., Ruan, Y., Stunnenberg, H. G., Swerdlow, H., Velculescu, V. E., Wilson, R. K., Xue, H. H., Yang, L., Spellman, P. T., Bader, G. D., Boutros, P. C., Flicek, P., Getz, G., Guigó, R., Guo, G., Haussler, D., Heath, S., Hubbard, T. J., Jiang, T., Jones, S. M., Li, Q., López-Bigas, N., Luo, R., Muthuswamy, L., Ouellette, B. F. F., Pearson, J. V., Quesada, V., Raphael, B. J., Sander, C., Speed, T. P., Stein, L. D., Stuart, J. M., Teague, J. W., Totoki, Y., Tsunoda, T., Valencia, A., Wheeler, D. A., Wu, H., Zhao, S., Zhou, G., Lathrop, M., Thomas, G., Yoshida, T., Axton, M., Gunter, C., Miller, L. J., Zhang, J., Haider, S. A., Wang, J., Yung, C. K., Cross, A., Liang, Y., Gnaneshan, S., Guberman, J., Hsu, J., Chalmers, D. R. C., Hasel, K. W., Kaan, T. S. H., Lowrance, W. W., Masui, T., Rodriguez, L. L., Vergely, C., Bowtel, D. D. L., Cloonan, N., DeFazio, A., Eshleman, J. R., Etemadmoghadam, D., Gardiner, B. A., Kench, J. G., Sutherland, R. L., Tempero, M. A., Waddell, N. J., Wilson, P. J., Gallinger, S., Tsao, M. S., Shaw, P. A., Petersen, G. M., Mukhopadhyay, D., DePinho, R. A., Thayer, S., Shazand, K., Beck, T., Sam, M., Timms, L., Ballin, V., Ji, J., Zhang, X., Chen, F., Hu, X., Yang, Q., Tian, G., Zhang, L., Xing, X., Li, X., Zhu, Z., Yu, Y., Yu, J., Tost, J., Brennan, P., Holcatova, I., Zaridze, D., Brazma, A., Egevad, L., Prokhortchouk, E., Banks, R. E., Uhlén, M., Viksna, J., Ponten, F., Skryabin, K., Futrea, P. A., Birney, E., Borg, A., Børresen-Dale, A. L., Caldas, C., Foekens, J. A., Martin, S., Reis-Filho, J. S., Richardson, A. L., Sotiriou, C., Veer, L. V. T., Birnbaum, D., Blanche, H., Boucher, P., Boyault, S., Masson-Jacquemier, J. D., Pauporté, I., Pivot, X., Vincent-Salomon, A., Tabone, E., Theillet, C., Treilleux, I., Bioulac-Sage, P., Decaens, T., OiseDegos, F., Franco, D., Gut, M., Samuel, D., Zucman-Rossi, J., Eils, R., Brors, B., Korbe, J. O., Korshunov, A., Landgraf, P., Lehrach, H., Pfister, S., Radlwimmer, B., Reifenberger, G., Taylor, M. D., Kalle, C. V., Majumder, P. P., Rao, T. S., Pederzoli, P., Lawlor, R. T., Delledonne, M., Bardelli, A., Gress, T., Klimstra, D., Zamboni, G., Nakamura, Y., Miyano, S., Fujimoto, A., Campo, E., Sanjosé, S. D., Montserrat, E., González-Dý́az, M., Jares, P., Himmelbaue, H., Bea, S., Aparicio, S., Easton, D. F., Collins, F. S., Compton, C. C., Lander, E. S., Burke, W., Green, A. R., Hamilton, S. R., Kallioniemi, O. P., Ley, T. J., Liu, E. T. & Wainwright, B. J., Apr 15 2010, In : Nature. 464, 7291, p. 993-998 6 p.

Research output: Contribution to journalReview article

1295 Scopus citations
2007

The Functional Genomics Experiment model (FuGE): An extensible framework for standards in functional genomics

Jones, A. R., Miller, M., Aebersold, R., Apweiler, R., Ball, C. A., Brazma, A., DeGreef, J., Hardy, N., Hermjakob, H., Hubbard, S. J., Hussey, P., Igra, M., Jenkins, H., Julian, R. K., Laursen, K., Oliver, S. G., Paton, N. W., Sansone, S. A., Sarkans, U., Stoeckert, C. J. & 5 others, Taylor, C. F., Whetzel, P. L., White, J. A., Spellman, P. & Pizarro, A., Oct 1 2007, In : Nature biotechnology. 25, 10, p. 1127-1133 7 p.

Research output: Contribution to journalReview article

76 Scopus citations
2006

FuGE: Functional Genomics Experiment Object Model

Jones, A. R., Pizarro, A., Spellman, P. & Miller, M., Sep 4 2006, In : OMICS A Journal of Integrative Biology. 10, 2, p. 179-184 6 p.

Research output: Contribution to journalReview article

25 Scopus citations
2004

Submission of microarray data to public repositories

Ball, C. A., Brazma, A., Causton, H., Chervitz, S., Edgar, R., Hingamp, P., Matese, J. C., Parkinson, H., Quackenbush, J., Ringwald, M., Sansone, S. A., Sherlock, G., Spellman, P., Stoeckert, C., Tateno, Y., Taylor, R., White, J. & Winegarden, N., Sep 1 2004, In : PLoS Biology. 2, 9

Research output: Contribution to journalReview article

96 Scopus citations
2001

Minimum information about a microarray experiment (MIAME) - Toward standards for microarray data

Brazma, A., Hingamp, P., Quackenbush, J., Sherlock, G., Spellman, P., Stoeckert, C., Aach, J., Ansorge, W., Ball, C. A., Causton, H. C., Gaasterland, T., Glenisson, P., Holstege, F. C. P., Kim, I. F., Markowitz, V., Matese, J. C., Parkinson, H., Robinson, A., Sarkans, U., Schulze-Kremer, S. & 4 others, Stewart, J., Taylor, R., Vilo, J. & Vingron, M., Dec 2001, In : Nature genetics. 29, 4, p. 365-371 7 p.

Research output: Contribution to journalReview article

3075 Scopus citations